I padri agostiniani arrivarono ad Altamura probabilmente negli anni 1530-1540, insediandosi dapprima in un ospizio annesso alla chiesa della Pietà. Poi dal 1540, su concessione della città, abitarono in una struttura monastica fuori le mura, dove sorgeva l’antica cappella dedicata a san Bartolomeo. Nel 1570, come ricorda la scritta sull’architrave d’ingresso, costruirono una nuova chiesa, dedicata dapprima a Santa Maria del Popolo, con l’annesso monastero. La presenza agostiniana finì con le leggi soppressione napoleoniche.
La struttura complessiva esprime nel disegno architettonico stilemi barocchi, frutto dei rifacimenti settecenteschi.